Brojni moduli i podsustavi EHIS bolničkog informacijskog sustava omogućuju njegovu primjenu neovisno o veličini i specijalizaciji medicinske ustanove od poliklinika do kliničkih bolničkih centara.
Kako bi se postigla maksimalna učinkovitost implementirano rješenje EHIS može se sastojati od različitih modula, ovisno o instituciji, procesima koje ona primjenjuje i njihovoj složenosti te drugim potrebama.